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蛋白質(zhì)技術(shù)專題:蛋白等電聚焦凝膠電泳技術(shù)(一)

日期:2024-11-23 10:30
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摘要:1.原理 等電聚焦凝膠電泳是依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點(diǎn)進(jìn)行分離的技術(shù),等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個(gè)連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場(chǎng)中形成正極為酸性,負(fù)極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點(diǎn)的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場(chǎng)中移動(dòng);當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點(diǎn)位置時(shí),其靜電荷數(shù)為零,在電場(chǎng)中不再移動(dòng),據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。
1.原理

等電聚焦凝膠電泳是依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點(diǎn)進(jìn)行分離的技術(shù),等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個(gè)連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場(chǎng)中形成正極為酸性,負(fù)極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點(diǎn)的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場(chǎng)中移動(dòng);當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點(diǎn)位置時(shí),其靜電荷數(shù)為零,在電場(chǎng)中不再移動(dòng),據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。
等電聚焦中,只有在凝膠兩端給以高電壓時(shí),才能獲得較好的蛋白質(zhì)條帶分辨率,這就需要非常有效的凝膠冷卻系統(tǒng)(否則會(huì)導(dǎo)致燒膠),即凝膠同期周圍液體之間的熱傳遞效率要高。由于平板膠熱傳遞能力高,并可方便的同時(shí)比較多種蛋白質(zhì)樣品,所以平板膠用在等電聚焦上的居多。
由于等電聚焦對(duì)蛋白質(zhì)的電荷差異非常敏感,若要好的重復(fù)性,制備蛋白樣品時(shí)一定要小心,要避免任何對(duì)蛋白質(zhì)化學(xué)組成和結(jié)構(gòu)的修飾。另外,蛋白質(zhì)-脂類、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用可引起電荷改變,進(jìn)而導(dǎo)致等電點(diǎn)遷移或紋理現(xiàn)象。除非特殊需要研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用或者必須保持蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能,等電聚焦通常在含有尿素的變性凝膠系統(tǒng)中進(jìn)行。使用非離子去垢劑也可以提高分辨率。

2.主要儀器、試劑

儀器:微型電泳系統(tǒng)、電源、注射器、固定和染色用容器 
試劑:丙稀酰胺、雙-丙稀酰胺、載體兩性電解質(zhì)、尿素、過(guò)硫酸胺、TEMED、TritonX-100、2-巰基乙醇、溴酚藍(lán)、磷酸、氫氧化鈉、氯化鉀、三***、考馬斯亮藍(lán)、甲醇、乙酸。 
儲(chǔ)存液:1)30%(w/v)丙稀酰胺,1%(w/v)雙-丙稀酰胺;2)20%Triton X100;3)10%三***;4)1%三***;5)1%溴酚藍(lán);6)考馬斯亮藍(lán)染色液;7)考馬斯亮藍(lán)脫色液;

3.載體兩性電解質(zhì)的選擇

載體兩性電解質(zhì)是一些具有相近等電點(diǎn)的分子量為600-900Da的多氨基多羥基兩性化合物的混合物,下面時(shí)配置不同pH范圍等電聚焦凝膠的載體兩性電解質(zhì)的配方:

4.灌膠

以灌制8cm×7cm×0.75mm pH4-6變性等電聚焦凝膠的配方。其他pH范圍等電聚焦可以參考表格來(lái)配置。

水:5.4ml; 儲(chǔ)存液1):2.0 ml; 載體兩性電解質(zhì)溶液pH3.5-10 48μl; 載體兩性電解質(zhì)溶液pH4-6 240μl; 超純尿素 6.0 g ;10%過(guò)硫酸胺25μl; TEMED:20μl

灌膠步驟:1)組裝灌膠器;2)將尿素、水、溶液1)和載體兩性電解質(zhì)溶液混勻,避免劇烈搖動(dòng),輕微加熱尿素溶解更快(帶手套,丙稀酰胺有毒);3)加入過(guò)硫酸胺和TEMED,輕輕混勻(開始聚合,操作要迅速);4)將上述混勻溶液倒如灌膠器(盡量避免氣泡產(chǎn)生);5)插入梳子,將梳子侵入膠內(nèi)(不要產(chǎn)生氣泡);6)聚合約1小時(shí);7)聚合完成,小心拔去梳子;8)將凝膠同冷卻裝置連接后插入電泳池,蛋白樣品上樣前好用陽(yáng)極電極液注入上槽中確定是否有滲漏。

注意:1)上樣前沖去上樣空底部未聚合的丙稀酰胺,否則電泳過(guò)程中會(huì)發(fā)生聚合;2)現(xiàn)在有商品化的等電聚焦凝膠,但只限于水平平板電泳系統(tǒng)(如Pharmmacia-LKB,Hoefer).

樣品制備和上樣: 
一般不同厚度的凝膠,不同的梳孔數(shù)目會(huì)有不同的上樣量,例如:0.75mm厚、15孔的凝膠每孔大上樣量大約15μl。

變性凝膠上樣緩沖液2×Buffer(適用于pH4-6):1)尿素:2.4g;2)pH3.5-10載體兩性電解質(zhì):20μl;3)pH4-6載體兩性電解質(zhì):100μl;4)20%Triton X-100:500μl:5)2-巰基乙醇:50μl;雙蒸水:1.7ml;1%溴酚藍(lán):200μl

5.電泳

操作步驟:

1)將蛋白樣品于等體積的2×上樣緩沖液混合,10000×g離心5min以除去蛋白質(zhì)沉淀;2)用微量注射器將蛋白質(zhì)樣品加入到上樣空底部,注意不要溢出來(lái)。注意:對(duì)于考馬斯亮藍(lán)染色液來(lái)說(shuō),每個(gè)泳道10-30ug的蛋白混合粗提物(我們俗稱粗抗原)或者5-10ug單一蛋白組分是較合理的上樣濃度。

電泳液:

1)上槽中加入陰極電泳液(20mM氫氧化鈉:須由1M儲(chǔ)存液新鮮配置);

2)下槽中加入陽(yáng)極電泳液(10mM磷酸:須由1M儲(chǔ)存液新鮮配置)。

等電聚焦電泳條件:

1)接好電極;

2)恒壓150V電泳30min;

3)恒壓200V電泳2.5h,開始時(shí)候控制電流為10mA左右,在聚焦過(guò)程中電流有所下降,電泳內(nèi)室溫度在電泳的過(guò)程中將升至40-50攝氏度。

6.電泳聚焦后處理

測(cè)定pH梯度:

1)將凝膠條切成0.5cm或1cm的小片;

2)將每小片凝膠在1ml 10mM KCl中 浸泡30min;

3)測(cè)讀此KCl溶液的pH值、

凝膠的固定:

1)將凝膠于10%三***中浸泡10min;

2)換成1%三***溶液繼續(xù)浸泡至少2h以上,以去除載體兩性電解質(zhì),浸泡過(guò)夜可以更好的降低考馬斯亮藍(lán)對(duì)載體兩性電解質(zhì)的染色。

凝膠的染色:用考馬斯亮藍(lán)染色,然后脫色,制成干膠。

7.天然等電聚焦電泳的修正方案

如果要進(jìn)行天然等電聚焦電泳,要做一些修改;

1) 膠過(guò)程中配的凝膠中不需要加尿素;

2)上樣緩沖液(2×)5ml:其中1.8ml水,200μl載體兩性電解質(zhì)(同制膠成分),3ml甘油,上樣時(shí)候于等體積樣品混勻,10000×g離心5敏即可上樣;

3)室溫下電泳,接好電極,恒壓下先200V電泳1.5h,再400V電泳1.5h。
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