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熒光定量PCR儀的誤區(qū)

日期:2024-10-22 22:54
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摘要:熒光定量PCR 因操作方便、運行速度快、實驗結(jié)果準確,受到越來越多的分子生物學研究者青睞。在實驗技術(shù)成熟的今天,也許對你來說,難得不是實驗技術(shù)上的問題——而是選擇哪種熒光定量PCR儀——你要征詢實驗室成員的意見、分析實驗室目前乃至將來的需求、平衡實驗室的預算,更要詳細研究各種富誘惑力的宣傳資料。面對各種不同性能的產(chǎn)品,您又該如何選擇呢? 先建議大走出認識熒光定量PCR的兩個誤區(qū): 誤區(qū):儀器通道越多越好 隨著PCR技術(shù)的成熟運用,多重擴增越來越熱鬧,熒光定量PCR儀也不能幸免。從初ABI公司推出...
熒光定量PCR 因操作方便、運行速度快、實驗結(jié)果準確,受到越來越多的分子生物學研究者青睞。在實驗技術(shù)成熟的今天,也許對你來說,難得不是實驗技術(shù)上的問題——而是選擇哪種熒光定量PCR儀——你要征詢實驗室成員的意見、分析實驗室目前乃至將來的需求、平衡實驗室的預算,更要詳細研究各種富誘惑力的宣傳資料。面對各種不同性能的產(chǎn)品,您又該如何選擇呢?

先建議大走出認識熒光定量PCR的兩個誤區(qū):

誤區(qū):儀器通道越多越好

隨著PCR技術(shù)的成熟運用,多重擴增越來越熱鬧,熒光定量PCR儀也不能幸免。從初ABI公司推出的單通道熒光定量PCR儀發(fā)展到如今各個廠都推出4通道、5通道甚至6通道熒光定量PCR儀,眼花繚亂的選擇讓人無所適從,就有人不小心走進了“通道越多越好”的誤區(qū)。

在使用有些廠5通道的熒光定量儀時,為了確保實驗結(jié)果的性和準確性都要在實驗中使用ROX(種熒光染料)或?qū)S玫腞eference dye ,這些熒光染料都必須單獨使用個檢測通道。這樣以來,真正能檢測多重PCR熒光信號的有效通道只有4個,而且使用校正染料可能會增加后期的使用成本。有的熒光定量PCR的檢測通道是只為自已廠的專用的熒光染料或試劑開放的,有效檢測通道也非像宣傳資料**稱的那么多。在購買前確認熒光定量PCR儀器的有效檢測通道尤為重要,不能單單只聽宣傳。
考慮多重熒光定量PCR的通道數(shù)的時候也應該從實驗室實際情況出發(fā),多重PCR并非人人適用、人人可用,因為它使實驗復雜化了。

誤區(qū):real-time PCR儀無需梯度功能

對于使用染料法的定量PCR反應,雖然有各種各樣的PCR引物設計軟件或者經(jīng)驗公式計算熔解溫度(Tm值),但運用的公式不同、引物序列不同,Tm值的差異會很大。引物的熔解溫度決定了退火溫度。而且模版中堿基的組合千變?nèi)f化,對于特殊片斷,經(jīng)驗公式得到的數(shù)據(jù)不定能得出準確的結(jié)果,退火溫度細微的差異對結(jié)果都可能產(chǎn)生決定性的影響,因而“摸條件”度是讓人很頭疼的問題。梯度PCR的出現(xiàn)部分解決了些問題——在反應過程中每個孔的溫度控制條件可以在指定范圍內(nèi)按照梯度變化,根據(jù)結(jié)果,步就可以摸索出適合的反應條件。

不單退火溫度,連變性溫度和延伸溫度都可以化——對于多種聚合酶混合酶擴增如Invitrogen、Clontech、Promega的多數(shù)保真Taq酶來說這個非常重要,因為Taq和校正酶的反應溫度可能有顯著差異,化延伸溫度就顯得很重要。

使用有梯度功能的熒光定量PCR可以次完成以往多次實驗才能完成的化過程,簡化了摸索 PCR反應條件的繁瑣實驗,既節(jié)省實驗時間提效率,又節(jié)省實驗成本。
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