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重磅!次定量檢測完整的人類蛋白質(zhì)組

日期:2024-10-22 10:56
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摘要: 2016年8月3日--在項(xiàng)新的研究中,來自瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院(ETH Zurich)和美系統(tǒng)生物學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)的研究人員開發(fā)出人類SRMAtlas(Human SRMAtlas),即靶向識別和可重復(fù)地定量預(yù)測的人類蛋白質(zhì)組中所有蛋白質(zhì)的度特異性質(zhì)譜檢測方法匯編目錄,包括許多剪接變異體、非同義突變和翻譯后修飾。利用種被稱作選擇性反應(yīng)監(jiān)控(selected reaction monitoring, SRM)的技術(shù),研究人員利用166174種已被充分了解的化學(xué)合成蛋白特征性肽(proteotypic peptide)開發(fā)出這些檢測方法。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2016年7月28日那期Ce...

2016年8月3日--在項(xiàng)新的研究中,來自瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院(ETH Zurich)和美系統(tǒng)生物學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)的研究人員開發(fā)出人類SRMAtlas(Human SRMAtlas),即靶向識別和可重復(fù)地定量預(yù)測的人類蛋白質(zhì)組中所有蛋白質(zhì)的度特異性質(zhì)譜檢測方法匯編目錄,包括許多剪接變異體、非同義突變和翻譯后修飾。利用種被稱作選擇性反應(yīng)監(jiān)控(selected reaction monitoring, SRM)的技術(shù),研究人員利用166174種已被充分了解的化學(xué)合成蛋白特征性肽(proteotypic peptide)開發(fā)出這些檢測方法。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2016年7月28日那期Cell期刊上,論文標(biāo)題為“Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome”。論文第作者為來自美系統(tǒng)生物學(xué)研究所的Ulrike Kusebauch博士。論文通信作者為來自美系統(tǒng)生物學(xué)研究所的Robert Moritz教授和來自瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的Ruedi Aebersold。

SRMAtlas資源在http://www.srmatlas.org網(wǎng)站上可以免費(fèi)獲取,將有助于公平地開展重點(diǎn)的、假設(shè)驅(qū)動(dòng)的和大型蛋白質(zhì)組規(guī)模的研究。研究人員期待這資源將大地加快基于蛋白質(zhì)的實(shí)驗(yàn)室生物學(xué)發(fā)展從而有助理解**轉(zhuǎn)化和健康軌跡,這是因?yàn)槿缃裨诶碚撋夏軌蜩b定和定量檢測出任何樣品中的任何人類蛋白。

能夠可靠地和可重復(fù)性地檢測任何組織或細(xì)胞類型的人類蛋白質(zhì)組中的任何種蛋白在理解系統(tǒng)層次的性質(zhì)以及正常生理下和患病時(shí)的特異性途徑方面引發(fā)變革。在Moritz教授實(shí)驗(yàn)室中,研究團(tuán)隊(duì)能夠利用SRM方法產(chǎn)生并驗(yàn)證了種由度特異性地靶向蛋白質(zhì)組檢測方法組成的匯編目錄,而且通過這種廣泛獲取的、靈敏的和強(qiáng)健的靶向質(zhì)譜方法SRM,能夠定量檢測20,277種已被標(biāo)注的人類蛋白中的99.7%。這種人類SRMAtlas明確的檢測坐標(biāo)來確定性地鑒別生物樣品中蛋白質(zhì)特征性的肽。

盡管2003年,人們成功地了完**類基因組計(jì)劃(Human Genome Project),構(gòu)建出所有人類基因的目錄,但是大多數(shù)蛋白質(zhì)研究仍然聚焦在在繪制出人類基因組圖譜之前科學(xué)們研究的蛋白中相對較小的部分蛋白上。若要超越這種停滯不前的蛋白質(zhì)-基因組學(xué)研究方法,就應(yīng)需要為幾乎每種人類蛋白開發(fā)度特異性的檢測方法。利用人類SRMAtlas等資源,測量任何種人類蛋白質(zhì)的前景如今變成現(xiàn)實(shí)。如今,人類SRMAtlas已經(jīng)過驗(yàn)證的質(zhì)譜檢測方法,這些檢測方法是基于種統(tǒng)的致的檢測人類蛋白質(zhì)組中幾乎每種蛋白的過程開發(fā)出的SRM技術(shù)而開發(fā)的。這些檢測方法可快速地用于系統(tǒng)生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中以便度靈敏地和度選擇性地鑒定和定量檢測任何種人類蛋白,以及指導(dǎo)完整的蛋白質(zhì)圖譜繪制來了解它們的生物學(xué)功能。

個(gè)人化醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)依賴于分子特征來監(jiān)控人們的健康狀態(tài),信號來鑒定健康軌跡發(fā)生的變化,以及先在臨床試驗(yàn)隨后在臨床實(shí)踐中信息來讓合適的患者匹配正確的**。這種人類SRMAtlas計(jì)劃穩(wěn)步地將蛋白組學(xué)推到前沿,并且為蛋白質(zhì)組學(xué)在*癥登月計(jì)劃(Cancer Moonshot)中發(fā)揮較大的作用添磚加瓦。

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